Στην παλιά Ιαπωνία, o Θρύλος των νίντζα αναβιώνει μέσω του "Γουατάρι, ο μικρός νίντζα". Μία ταινία που δεν συγκρίνεται με καμμία άλλη. Πρόκειται για την ιστορία ενός μικρού αγοριού με σχεδόν μυστικιστικές δυνάμεις. Οι ικανότητες του στην τέχνη των νίντζα ξεπερνούν κάθε φαντασία, καθώς διεισδύει στην αντίπαλη ομάδα της Ίνγκα, για να ξεσκεπάσει τα ύπουλα σχέδια του σατανικού τους ηγέτη.
