Мата Нуи, някога могъщ и велик владетел, се оказва захвърлен в металната пустош, далече от дома. Той е далече от Бара Магна и е принуден да влезе в гладиаторски борби срещу Скралите и Ловците на кости. Местните жители, наречени Агори го молят за помощ срещу жестоката армия на племето наречено Скрал и техният лидер Тума. Мата Нуи започват да учи агорите как да се защитят, като им предава някои от своите специални сили и умения. Така те постепенно започват да разкриват неведомите страни на удивителната тайна "Бионикъл".
